蠶蛹長時間儲存方法是放冰箱冷凍。放在冰箱中冷凍儲存，可儲存一年左右。蠶蛹常溫儲存一週左右的時間都可以，但是氣溫不能過高，蠶蛹適合在低溫下生存，如果是在秋冬季儲存的時間還要長一些，可以儲存兩週以上的時間。如果蠶蛹還活著，放進冰箱冷凍不會超過2個小時就會被凍死。
儲存蠶蛹，還可以把蠶蛹煮熟，放鹽醃製好再進行存放。這種方式要常溫儲存，不過，要根據季節來決定儲存時間。一般來說，秋冬季節可以儲存1~2個星期，春夏季節能儲存1個星期，在此之前食用味道最佳。
新鮮蠶蛹，在放進冰箱裡儲存之前，可以放到鹽水中浸泡2~3個小時，這樣能起到殺菌和殺滅寄生蟲的效果。因為蠶蛹前肢窩處和肚子褶皺處可能會有細小的寄生蟲，所以用鹽浸泡一下食用起來更放心，其儲存時間也會更長。
蠶蛹可以用保鮮袋密封好，也能用塑料袋密封好，之後放進冰箱冷凍。蠶蛹經過冷凍後，下次食用前，一定要把蠶蛹充分解凍，若炸制食用，一定要將蠶蛹炸透，特別是肚子那部分，可以用鏟子按住蠶蛹肚子進行炸制，只有把肚子炸透，這樣才能放心食用。
