歷史上諸葛亮因操勞過度，導致舊病復發病死於五丈原。但是具體病因是什麼，包括《三國志》在內的史書資料都沒有提及，不過根據諸葛亮生前的生活習慣來看，他死於消化系統疾病和心腦血管疾病的可能性很大。諸葛亮年輕時經常駕小舟出遊，生活沒有規律，身體長時保持這樣的姿勢影響食物消化。
蜀國中期，多員大將的離世，再加上幾次北伐的失敗，讓諸葛亮的內心世界崩潰脆弱到極點。最終由於心病加上舊疾，諸葛亮病逝於五丈原，終年54歲。諸葛亮遺言命令部下將自己葬在漢中定軍山，依山勢修建墳墓，墓穴僅能容納下棺材。
諸葛亮曾經上表指出自己沒有多餘財產，只有800株桑樹和15頃土地，而自己穿的都是朝廷賜封，就算兒子都是自給自足，自己沒有一點多餘的財產。果然，諸葛亮直至死時也是如此，甚至在臨死前，也吩咐了他下葬時只需要挖洞一個，棺木能夠放進去便足夠，自己則穿著平常的服裝即可，不須要其他配葬物。武侯墓在定軍山勉縣。
諸葛亮是三國時期傑出的政治家和軍事家，身為丞相，諸葛亮深知：“屋漏在下，止之在上，上漏不止，下不可居也。”他不僅帶頭廉政，樹起一面旗幟，同時還把廉政作為一項重要的政治、法律建設來抓，對蜀漢政治、經濟、軍事、文化的方方面面，都產生了重大影響。
