電熱水器可以請專業的維修人員除垢，或者自行除垢。先斷開電源，將熱水口和冷水口的螺帽都擰開把熱水口堵住，冷水口接軟管排水直到排光冷水口的水。然後將水管接在熱水口，接上水龍頭灌水，沉澱一會之後再開啟冷水口排水，反覆幾次即可。
電熱水器有水垢是因為使用的時間過久，很容易積累汙垢。電熱水器這種裝置的整體性很強，因此在除垢時最好請專業的維修人員，但一般費用都比較貴。自行除垢也是可以的，但是要注意安全。
在清洗電熱水器之前，一定要拔掉電熱水器的電源以及插座。最好將自己屋內的總電源都關閉。還要關閉進水閥和出水閥，以免在清洗的時候漏水。在排水時不排熱水口是因為它放出來的水都是清澈的，這是因為熱水管在高處，而冷水管在低處，每次的水垢都會沉澱在下面，只有用冷水管才能排出。
