1、志願填報的時間不同：本科二批A段志願填報和錄取時間要在本科二批B段之前進行。2、錄取院校不同：本科二批A段的報考院校是一般本科院校，本科二批B段的報考院校多是近年來升為本科的原專科院校。3、錄取分數不同：科二批A段院校的錄取分數線要普遍高於本科二批B段院校。
本科第二批是指放在本科第二批次招生的學校，錄取線一般要達到二本線。第二批(普通)本科控制線第二批本科控制線又稱一般本科線，是所有本科院校錄取新生的底線。普通本科院校為數眾多，錄取新生的總數也很多。
本科一批、本科二批和本科三批一樣，屬於本科學歷，畢業後頒發本科學歷畢業證書和學士學位證書，除了學校或專業不同以外其他沒有其他區別。
在普通大學聯考錄取的時候，提前批最先錄取，接著就是本科一批、本科第二批。然後是本科第三批、專科批。本科一批、本科二批和本科三批都屬於本科學歷，學歷均為本科，但三本為獨立學院和民辦院校，在收費和社會認知上存在差異。
因招生批次為每個省自定，且是涵蓋所有在該省市招生的普通高等學校的，加之地方偏袒等原因，招生批次並無法真實展示學校實力，因而教育部支援全國各省份儘快取消所有批次，促進依法治教，依法治校，促進大學聯考和普通高等學校更深層次的改革。
